Over Ons
Onderzoeksgroepen
Vrienden
Credits: Danny Sahtoe. Copyright: Hubrecht Institute.
Terug naar onderzoeksgroepen
De Sahtoe groep ontwerpt nieuwe eiwitmoleculen om de moleculaire en mechanistische grondslagen van het leven bloot te leggen.
Het leven op aarde wordt voor een groot deel mogelijk gemaakt door eiwitten. Deze moleculen regelen processen variërend van metabolisme tot genregulatie en vormen vaak strak gereguleerde complexen met katalytische en/of allosterische activiteiten. Dergelijke geavanceerde complexen kunnen licht omzetten in energie, ziekteverwekkers elimineren of DNA-schade herstellen. De Sahtoe groep heeft tot doel nieuwe eiwitsystemen met zulke geavanceerde functies te ontwerpen. Hierdoor kunnen we de moleculaire basis van de natuurlijke eiwitfuncties beter begrijpen en nieuwe eiwitsystemen ontwerpen met functionaliteiten die niet in de natuur voorkomen, om deze vervolgens te gebruiken voor biomedische en biotechnologische toepassingen.
De genetische informatie van eukaryoten is zorgvuldig georganiseerd in chromatine, waarin DNA wordt gecondenseerd door interacties met gespecialiseerde DNA-bindende eiwitten. Deze eiwitten regelen samen met chemische aanpassingen van chromatine, de expressie (of activiteit) van genen op epigenetische wijze, ofwel zonder de DNA-sequentie te veranderen. Zodoende beheersen deze eiwitten vrijwel alle processen in eukaryoten. Omdat epigenetische processen bij ziekte vaak niet goed gereguleerd zijn, is het belangrijk om de moleculaire epigenetische mechanismen in detail te bestuderen. Wij ontwerpen nieuwe eiwitten die een interactie aangaan met de bestaande chromatinefactoren om deze mechanismen te bestuderen.
Eiwitbinding, katalyse en allosterie zijn moleculaire kenmerken van het leven die geavanceerde eiwitfuncties mogelijk maken in de natuur. Deze functies zijn vaak onderworpen aan meerdere lagen van regulering, vaak door eiwit-eiwitinteracties. We creëren dergelijke complexe systemen op de computer en meten hun activiteiten in vitro om een gedetailleerd inzicht te krijgen in de onderliggende biochemische en biofysische mechanismen. Onze inzichten kunnen worden gebruikt om natuurlijke eiwitsystemen te begrijpen. De gedetailleerde kennis die we opdoen zal het ontwerpen van nieuwe therapieën mogelijk maken, die meer doen dan slechts het blokkeren van eiwit-eiwitinteracties maar bijvoorbeeld ook kunnen reageren op hun moleculaire omgeving om zo bijwerkingen beperken.
Sahtoe DD, Andrzejewska EA, [...] Knowles TPJ, Baker D.
Download|2024
Sahtoe DD, Praetorius F [...] Bera AK and Baker D
Download|2022
Sahtoe DD, Coscia A [...] Abraham J and Baker D
Download|2021
Sahtoe DD, Dijk WJ, van, Ekkebus R, Ovaa H and Sixma TK
Download|2016
Sahtoe DD, Dijk WJ, van [...] Ovaa H and Sixma TK
Download|2015
Sahtoe DD and Sixma TK
Danny Sahtoe begon in 2023 als groepsleider bij het Hubrecht Instituut, na een PhD in structuurbiologie en een postdoc in computationeel eiwitontwerp. Zijn groep ontwerpt nieuwe eiwitsystemen voor biomedisch en biotechnologisch gebruik, en om de mechanistische basis van het leven in gezondheid en ziekte beter te begrijpen. De Sahtoe groep gebruikt computationele methoden voor eiwitontwerp, ‘high-throughput’ experimentele screening en verschillende biofysische technieken om eiwitsystemen te karakteriseren.
2023- Groepsleider bij het Hubrecht Instituut 2023 Junior Oncode Investigator 2016-2022 Postdoctoraal onderzoeker in de groep van Prof. David Baker, Institute for Protein Design, University of Washington 2009-2015 PhD in de groep van prof. Titia Sixma, Nederlands Kanker Instituut
2015 EMBO long term fellowship 2015 Washington Research Foundation Innovation fellowship 2023 Ontvanger van een NWO-VIDI beurs
Contact
Group Leader
Technician
PhD Student
Show all group members
Students are encouraged to apply for an internship by emailing Danny Sahtoe.
