Garaycoechea: Metabolische mutagenese

Terug naar onderzoeksgroepen

De Garaycoechea-groep onderzoekt hoe de interactie tussen metabolisme en DNA-herstel leidt tot mutatie in een fysiologische setting.

Ons DNA draagt ​​de instructies van het leven, maar staat ook constant onder vuur. De resulterende schade, indien niet hersteld, leidt tot mutatie en ziekte. Gemeenschappelijke omgevingsmutagenen zijn zonlicht en sigarettenrook, maar de integriteit van DNA wordt ook bedreigd door chemicaliën die door ons eigen lichaam worden geproduceerd. Onze groep wil begrijpen wat de metabolieten zijn die binnen cellen voorkomen die DNA beschadigen, en de gevolgen van deze schade. In het bijzonder zijn we geïnteresseerd in het begrijpen van het behoud van de stabiliteit van het genoom in stamcellen, de zeldzame celpopulaties die verantwoordelijk zijn voor weefselbehoud.

Key publicationsView all publications

Aldehyde-driven transcriptional stress triggers an anorexic DNA damage response

Mulderrig L, Garaycoechea JI, Tuong ZK, Millington CL, Dingler FA, Ferdinand JR, Gaul L, Tadross JA, Arends MJ, O'Rahilly S, Crossan GP, Clatworthy MR, Patel KJ

Nature. Dec;600(7887):158-163

Download|2021

Alcohol and endogenous aldehydes damage chromosomes and mutate stem cells

Garaycoechea JI, Crossan GP, Langevin F, Mulderrig L, Louzada S, Yang F, Guilbaud G, Park N, Roerink S, Nik-Zainal S, Stratton MR, Patel KJ

Nature 11;553(7687):171-177

Download|2018

Endogenous formaldehyde is a hematopoietic stem cell genotoxin and metabolic carcinogen

Pontel LB, Rosado IV, Burgos-Barragan G, Garaycoechea JI, Yu R, Arends MJ, Chandrasekaran G, Broecker V, Wei W, Liu L, Swenberg JA, Crossan GP, Patel KJ

Mol Cell 1;60(1):177-88

Download|2015

Genotoxic consequences of endogenous aldehydes on mouse haematopoietic stem cell function

Garaycoechea JI, Crossan GP, Langevin F, Daly M, Arends MJ, Patel KJ

Nature. Sep 27;489(7417):571-5

Download|2012

PLoS Genet. 2020 Apr 9;16(4):e1008555

Download|2020

Single-cell genome sequencing of human neurons identifies somatic point mutation and indel enrichment in regulatory elements

Luquette LJ, Miller MB, Zhou Z, Bohrson CL, Zhao Y, Jin H, Gulhan D, Ganz J, Bizzotto S, Kirkham S, Hochepied T, Libert C, Galor A, Kim J, Lodato MA, Garaycoechea JI, Gawad C, West J, Walsh CA, Park PJ

Nat Genet. Oct;54(10):1564-1571

Download|2022

Groepsleider

Juan Garaycoechea

Juan Garaycoechea begon zijn wetenschappelijke carrière in Argentinië, waar hij in 2010 een eerste klas graad in biotechnologie behaalde aan de Universidad Nacional de Quilmes. Hij kreeg vervolgens de César Milstein-beurs voor zijn promotieonderzoek aan het MRC Laboratorium voor Moleculaire Biologie (LMB) in Cambridge, Engeland. Aan het einde van zijn studie ontving Juan een Junior Research Fellowship van King’s College, Cambridge om zijn postdoctorale onderzoek aan de LMB te ondersteunen. Hij is groepsleider bij het Hubrecht Institute vanaf oktober 2018, waar hij de metabolieten bestudeert die DNA beschadigen en hoe dit leidt tot mutatie in een fysiologische context.


Groepsleden

Juan Garaycoechea

Group Leader

Laurynas Leiteris

Technician

Jeroen Willems

Technician

Linda Bakker

Technician

Yang Jiang

Postdoc

Joeri van Strien

Postdoc

Job Smink

PhD Student

Marin Mondria

PhD Student

Nick Pelzers

PhD Student

Stefania Di Ciccio

PhD Student

Show all group members