Jop Kind ontvangt €250.000 uit het KNAW-onderzoeksfonds

Huidige kankerdiagnostiek

Bloed kan celvrij DNA (cfDNA) bevatten dat afkomstig is van afstervende cellen, bijvoorbeeld van tumoren. Dit cfDNA bevat daarom belangrijke informatie over iemands fysiologische gesteldheid. Kankerdiagnostiek op basis van cfDNA in vloeibare biopten is veelbelovend in het sturen van de behandeling en screening op terugkerende ziekte. De huidige diagnostische strategieën zijn echter kostbaar en arbeidsintensief, en schieten over het algemeen tekort bij het opsporen van kanker in een vroeg stadium.

Cel identificatie

In een cel wordt DNA verpakt in een structuur die is opgebouwd uit zogenaamde nucleosomen. Afhankelijk van het type cel, bevatten deze nucleosomen een breed scala aan post-translationele modificaties (PTM’s); verschillende typen cellen bevatten verschillende PTMs. Het uitlezen van PTMs is daarom relevant om te identificeren van welk celtype het DNA afkomstig is. Onlangs ontdekten onderzoekers dat cfDNA in bloed nog steeds rond nucleosomen – die hun PTMs hebben behouden – is gewikkeld.

Nieuwe technologie

De Kind-groep gaat met de subsidie van het KNAW-onderzoeksfonds een nieuwe technologie ontwikkelen voor het vroegtijdig opsporen van kanker op basis van een bloedmonster. Deze technologie zal de PTMs aanwezig op nucleosomen gebruiken om te bepalen van welke cel cfDNA afkomstig is. In samenwerking met de Medema-groep (Amsterdam UMC), zullen de onderzoekers evalueren hoe goed de nieuwe methode onderscheid maakt tussen verschillende subtypes van darmkanker. Het uiteindelijke doel van het project is om een eenvoudige methode te ontwikkelen die met slechts een paar druppels bloed verschillende soorten kanker vroegtijdig kan opsporen. De vroege diagnostiek van kanker wordt daarmee drastisch verbeterd.

Vacature

Vanwege dit nieuwe project is er plaats voor een postdoc in de Kind groep. Meer informatie over de openstaande vacature is hier te vinden.